Here is a list of all functions with links to the classes they belong to:

- s -

• sanityCheck() : nnp::settings::Settings
• scale() : nnp::ModeCabana< t_device >, nnp::SymFnc
• scalingLine() : nnp::ElementCabana, nnp::SymFnc
• screening_df() : LAMMPS_NS::PairHDNNP4G
• screening_f() : LAMMPS_NS::PairHDNNP4G
• ScreeningFunction() : nnp::ScreeningFunction
• selectSets() : nnp::Training
• sendStructure() : nnp::Dataset
• set_grid_global() : LAMMPS_NS::KSpaceHDNNP
• set_grid_local() : LAMMPS_NS::KSpaceHDNNP
• setAsymmetric() : nnp::CompactFunction, nnp::CoreFunction
• setAtomicEnergyOffset() : nnp::Element
• setBoxVectors() : nnp::InterfaceLammps
• setCacheIndices() : nnp::Element
• setCenterWidth() : nnp::CompactFunction
• setCompactFunction() : nnp::SymFncBaseComp
• setConnections() : nnp::NeuralNetwork
• setCoreFunction() : nnp::CompactFunction, nnp::ScreeningFunction
• setCutoffFunction() : nnp::Element, nnp::ElementCabana, nnp::SymFncBaseCutoff
• setCutoffParameter() : nnp::CutoffFunction
• setCutoffRadius() : nnp::CutoffFunction
• setCutoffType() : nnp::CutoffFunction
• setDescription() : nnp::settings::Key
• setElecDone() : nnp::InterfaceLammps
• setElementMap() : nnp::Structure
• setEpochSchedule() : nnp::Training
• setError() : nnp::GradientDescent, nnp::KalmanFilter, nnp::Updater
• setGlobalStructureStatus() : nnp::InterfaceLammps
• setHardness() : nnp::Element
• setIndex() : nnp::SymFnc, nnp::SymGrp
• setIndexPerElement() : nnp::SymFnc
• setInnerOuter() : nnp::ScreeningFunction
• setInput() : nnp::NeuralNetwork
• setJacobian() : nnp::GradientDescent, nnp::KalmanFilter, nnp::Updater
• setLeftRight() : nnp::CompactFunction
• setLineNumber() : nnp::SymFnc
• setLocalAtomPositions() : nnp::InterfaceLammps
• setLocalAtoms() : nnp::InterfaceLammps
• setLocalTags() : nnp::InterfaceLammps
• setmask() : LAMMPS_NS::FixHDNNP
• setMaxQSigma() : nnp::EwaldSetup
• setNormalizeNeurons() : nnp::NeuralNetwork
• setParameters() : nnp::SymFnc, nnp::SymFncBaseCompAng, nnp::SymFncBaseCompAngWeighted, nnp::SymFncBaseExpAng, nnp::SymFncCompRad, nnp::SymFncCompRadWeighted, nnp::SymFncExpAngnWeighted, nnp::SymFncExpRad, nnp::SymFncExpRadWeighted
• setParametersAdam() : nnp::GradientDescent
• setParametersFadingMemory() : nnp::KalmanFilter
• setParametersFixed() : nnp::GradientDescent
• setParametersStandard() : nnp::KalmanFilter
• setQsigma() : nnp::Element
• setScaling() : nnp::Element, nnp::ElementCabana
• setScalingFactors() : nnp::SymGrp, nnp::SymGrpBaseCompAng, nnp::SymGrpBaseCompAngWeighted, nnp::SymGrpBaseExpAng, nnp::SymGrpCompRad, nnp::SymGrpCompRadWeighted, nnp::SymGrpExpAngnWeighted, nnp::SymGrpExpRad, nnp::SymGrpExpRadWeighted
• setScalingNone() : nnp::Element
• setScalingType() : nnp::ElementCabana, nnp::SymFnc
• setSingleWeight() : nnp::Training
• setSizeObservation() : nnp::KalmanFilter
• setStage() : nnp::Training
• setState() : nnp::GradientDescent, nnp::KalmanFilter, nnp::Updater
• settings() : LAMMPS_NS::KSpaceHDNNP, LAMMPS_NS::PairHDNNP4G, LAMMPS_NS::PairHDNNP, LAMMPS_NS::PairHDNNPExternal
• settingsGetValue() : nnp::Mode
• settingsKeywordExists() : nnp::Mode
• setTrainingLogFileName() : nnp::Training
• setTruncMethod() : nnp::EwaldSetup
• setType() : nnp::CoreFunction
• setup() : LAMMPS_NS::KSpaceHDNNP, nnp::KspaceGrid, nnp::Prediction
• setup_pre_force() : LAMMPS_NS::FixHDNNP
• setupCutoff() : nnp::Mode
• setupCutoffMatrix() : nnp::Mode
• setupElectrostatics() : nnp::Mode
• setupElementMap() : nnp::Mode, nnp::ModeCabana< t_device >
• setupElements() : nnp::Mode, nnp::ModeCabana< t_device >
• setupFileOutput() : nnp::Training
• setupGeneric() : nnp::Mode
• setupMPI() : nnp::Dataset
• setupNeighborCutoffMap() : nnp::Structure
• setupNeuralNetwork() : nnp::Mode, nnp::ModeCabana< t_device >
• setupNeuralNetworkWeights() : nnp::Mode, nnp::ModeCabana< t_device >
• setupNormalization() : nnp::Mode
• setupNumericDerivCheck() : nnp::Training
• setupRandomNumberGenerator() : nnp::Dataset
• setupSelectionMode() : nnp::Training
• setupSymmetryFunctionCache() : nnp::Mode
• setupSymmetryFunctionGroups() : nnp::Element, nnp::ElementCabana, nnp::Mode, nnp::ModeCabana< t_device >
• setupSymmetryFunctionMemory() : nnp::Element, nnp::Mode
• setupSymmetryFunctions() : nnp::Mode, nnp::ModeCabana< t_device >
• setupSymmetryFunctionScaling() : nnp::Mode, nnp::ModeCabana< t_device >
• setupSymmetryFunctionScalingNone() : nnp::Mode
• setupSymmetryFunctionStatistics() : nnp::Mode
• setupTiming() : nnp::Updater
• setupTraining() : nnp::Training
• setupUpdatePlan() : nnp::Training
• setWeights() : nnp::Training
• shuffleUpdateCandidates() : nnp::Training
• size() : nnp::ElementMap
• sortMembers() : nnp::SymGrp, nnp::SymGrpCompAngn, nnp::SymGrpCompAngnWeighted, nnp::SymGrpCompAngw, nnp::SymGrpCompAngwWeighted, nnp::SymGrpCompRad, nnp::SymGrpCompRadWeighted, nnp::SymGrpExpAngn, nnp::SymGrpExpAngnWeighted, nnp::SymGrpExpAngw, nnp::SymGrpExpRad, nnp::SymGrpExpRadWeighted
• sortNeighborList() : nnp::Structure
• sortNeighborLists() : nnp::Dataset
• sortSymmetryFunctions() : nnp::Element, nnp::ElementCabana
• sortUpdateCandidates() : nnp::Training
• start() : nnp::Stopwatch
• status() : nnp::GradientDescent, nnp::KalmanFilter, nnp::Updater
• statusHeader() : nnp::GradientDescent, nnp::KalmanFilter, nnp::Updater
• stop() : nnp::Stopwatch
• stopTime() : nnp::Stopwatch
• Stopwatch() : nnp::Stopwatch
• Structure() : nnp::Structure
• symbol() : nnp::ElementMap
• symbolFromAtomicNumber() : nnp::ElementMap
• SymFnc() : nnp::SymFnc
• SymFncBaseComp() : nnp::SymFncBaseComp
• SymFncBaseCompAng() : nnp::SymFncBaseCompAng
• SymFncBaseCompAngWeighted() : nnp::SymFncBaseCompAngWeighted
• SymFncBaseCutoff() : nnp::SymFncBaseCutoff
• SymFncBaseExpAng() : nnp::SymFncBaseExpAng
• SymFncCompAngn() : nnp::SymFncCompAngn
• SymFncCompAngnWeighted() : nnp::SymFncCompAngnWeighted
• SymFncCompAngw() : nnp::SymFncCompAngw
• SymFncCompAngwWeighted() : nnp::SymFncCompAngwWeighted
• SymFncCompRad() : nnp::SymFncCompRad
• SymFncCompRadWeighted() : nnp::SymFncCompRadWeighted
• SymFncExpAngn() : nnp::SymFncExpAngn
• SymFncExpAngnWeighted() : nnp::SymFncExpAngnWeighted
• SymFncExpAngw() : nnp::SymFncExpAngw
• SymFncExpRad() : nnp::SymFncExpRad
• SymFncExpRadWeighted() : nnp::SymFncExpRadWeighted
• SymFncStatistics() : nnp::SymFncStatistics
• SymGrp() : nnp::SymGrp
• SymGrpBaseComp() : nnp::SymGrpBaseComp
• SymGrpBaseCompAng() : nnp::SymGrpBaseCompAng
• SymGrpBaseCompAngWeighted() : nnp::SymGrpBaseCompAngWeighted
• SymGrpBaseCutoff() : nnp::SymGrpBaseCutoff
• SymGrpBaseExpAng() : nnp::SymGrpBaseExpAng
• SymGrpCompAngn() : nnp::SymGrpCompAngn
• SymGrpCompAngnWeighted() : nnp::SymGrpCompAngnWeighted
• SymGrpCompAngw() : nnp::SymGrpCompAngw
• SymGrpCompAngwWeighted() : nnp::SymGrpCompAngwWeighted
• SymGrpCompRad() : nnp::SymGrpCompRad
• SymGrpCompRadWeighted() : nnp::SymGrpCompRadWeighted
• SymGrpExpAngn() : nnp::SymGrpExpAngn
• SymGrpExpAngnWeighted() : nnp::SymGrpExpAngnWeighted
• SymGrpExpAngw() : nnp::SymGrpExpAngw
• SymGrpExpRad() : nnp::SymGrpExpRad
• SymGrpExpRadWeighted() : nnp::SymGrpExpRadWeighted